A investigação do Ministério Público do Rio de Janeiro foi aberta no dia 23 de setembro e apura eventual improbidade administrativa no caso.
Segundo publicado pelo portal G1, o MPRJ deixou claro que a investigação não tem relação com o inquérito sobre supostas "rachadinhas" sobre o salário de assessores do ex-deputado estadual.
A investigação do novo inquérito já teria emitido ofícios para obter informações da Assembleia Legislativa do Rio de Janeiro (ALERJ) e apurar o caso do "funcionários fantasmas".
Devido ao sigilo das investigações, o Ministério Público não divulgou mais informações. Ainda segundo o G1, a defesa do agora senador Flávio Bolsonaro negou quaisquer atividades ilegais.