Um porta-voz de Shanahan disse que o secretário interino "recusa-se durante a duração de seu serviço" no Departamento de Defesa "de participar de assuntos nos quais a Boeing Company é parte", informa o Defense News.
O tenente-coronel Joe Buccino, porta-voz do vice-secretário da época, disse à Bloomberg em 21 de dezembro de 2018 que "os assessores jurídicos do Departamento têm um processo de seleção para garantir que as questões relacionadas à Boeing não sejam encaminhadas a Shanahan". Embora os detalhes da solicitação de orçamento do Departamento para o EF2020 permaneçam pré-decisórios, o processo de triagem foi implementado durante a revisão do orçamento para garantir que quaisquer decisões programáticas do Departamento de Defesa que afetassem a Boeing não fossem feitas nem influenciadas por Shanahan.
Shanahan tornou-se secretário interino de defesa na segunda-feira, quando o reformado general James Mattis concluiu seu último dia como secretário de Defesa. As conquistas de Shanahan no setor privado incluem ajudar a colocar o 787 Dreamliner da Boeing em produção e liderar as divisões do Sistema de Defesa de Mísseis e do Sistema Rotocraft da empresa, de acordo com o Departamento de Defesa.