A medida passa a entrar em vigor a partir desta sexta-feira (8) e deve durar até fevereiro. As informações foram publicadas pela agência Reuters.
"A pandemia global tem sido mais dura do que esperávamos, mas tenho esperança de que poderemos superar isso", afirmou Suga em pronunciamento.
A declaração do estado de emergência ocorre a menos de 200 dias dos Jogos Olímpicos de Tóquio.
"Devo pedir aos cidadãos que suportem a vida com algumas restrições", pediu o primeiro-ministro.
As autoridades de saúde japonesas pretendem iniciar a campanha de vacinação da população em fevereiro.
As medidas de emergência incluem a redução do funcionamento de restaurantes e bares, bem como a limitação do número de pessoas em grandes eventos.
O governo japonês também pediu para que a população só saia de casa em caso de necessidade e que os cidadãos trabalhem mais de suas residências.
O governo metropolitano de Tóquio disse anteriormente que as exibições da tocha olímpica na capital foram adiadas.