A administração de Trump foi alertada para não eleger Flynn para assumir a Defesa nacional durante a reunião realizada na Casa Branca após a vitória de Trump nas eleições de novembro de 2016.
O ex-presidente teria dito que "não era grande fã" do General Flynn.
Flynn foi afastado do cargo depois de se verificar que ele havia mentido para o vice-presidente Mike Pence sobre suas conversas com o embaixador russo nos EUA, Sergei Kislyak.
O porta-voz da Casa Branca, Sean Spicer, afirmou que a administração de Obama havia julgado a questão e não tomou medidas para suspender a autorização de segurança de Flynn.