Em abril de 2016, Sisi assinou um acordo com a Arábia Saudita referente à demarcação das fronteiras marítimas, transferindo o controle das ilhas de Tiran e de Sanafir, no Mar Vermelho, para a jurisdição de Riad. A decisão suscitou forte oposição pública, provocando inúmeras ações judiciais nos tribunais nacionais para contestar a validade da medida. No início de junho, o acordo recebeu aprovação oficial do parlamento egípcio.
O Tribunal Constitucional Supremo do Egito suspendeu temporariamente a execução de todas as decisões judiciais anteriores relativas à transferência das ilhas.