O presidente do Comitê Militar da Aliança Atlântica, general Petr Pavel, declarou que, embora qualquer país tenha o direito de tomar suas próprias decisões de segurança nacional, a aquisição dos sistemas S-400 russos por parte de Ancara pode levar à exclusão do país do sistema integrado de defesa aérea da OTAN, bem como outras restrições técnicas.
O Alto Comando enfatizou que "seria justo que os aliados tivessem essa discussão para levantar todos os problemas e possíveis dificuldades". Segundo Pavel, a mera presença dos sistemas russos na região "gera dificuldades" para a implantação das infra-estruturas dos países aliados no território do país.
A Turquia é um aliado da OTAN e onde a Aliança aloca os caças F-35 que fazem parte do programa "Joint Strike Fighter".
Ao mesmo tempo, Pavel observou que a Turquia continua a ser uma parte fundamental da OTAN, embora alguns "grupos externos" tenham manifestado sua preocupação com a falta de democracia na Turquia de Erdogan.